경실련은 "감사인원의 부족으로 매년 1회 이상 감사 실시가 어렵다는 문제 역시 미래부는 의무적으로 KAIT에 매년 1회 이상 감사를 실시해야 하지만, 지금까지 단 한 차례도 감사를 실시하지 않았다"는 지적에 대해 "감사원은 민간위탁에 대해 매년 감사를 실시하는 것이 원칙이지만, 미래부가 대부분의 행정기관처럼 감사인력의 부족 등으로 매년 감사를 실시하는 것이 현실적으로 어렵다면서, 미래부가 감사는 하지 않지만 부정가입방지시스템 구축·운영 등 KAIT에 민간 위탁한 사무에 대해 수시로 업무보고 및 현장 점검을 한다는 점, 2017년 하반기에 KAIT에 대한 종합감사를 실시할 계획이라는 점 등을 들어, 감사를 하지 않은 것에 대해 면죄부를 주었다"면서 강하게 비난했다.

경실련 관계자는 계속해서 "'행정권한의 위임 및 위탁에 관한 규정' 제16조에는 위탁기관의 장은 민간위탁사무의 처리 결과에 대해 매년 1회 이상 감사를 하도록 규정하고 있다. ‘할 수 있다’가 아닌 ‘하여야 한다’이다. 그 어디에도 예외조항은 없다"며 "미래부가 감사를 실시하지 않은 것은 엄연한 규정 위반이며, 이러한 미래부에 대하여 궁핍한 이유를 들어 면죄부를 주고 있는 감사원의 기각결정 또한 도저히 납득이 되지 않는 행위"라고 반박했다.